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lifechemicals預(yù)鍍分集簡(jiǎn)介

 更新時(shí)間:2021-11-22 點(diǎn)擊量:1026



lifechemicals預(yù)鍍分集簡(jiǎn)介

Life Chemicals 展示了其 Pre-plate Diversity Sets (PS6),由總共50,000 種具有最佳理化特性的新型篩選化合物組成,這些化合物通過(guò)從 Life Chemicals HTS新合成分子的化合物集合進(jìn)行的相異性搜索選出。它旨在通過(guò)以方便的方式提供對(duì)結(jié)構(gòu)多樣的小分子集合的訪問(wèn),以促進(jìn)表型(基于細(xì)胞)和基于目標(biāo)的高通量篩選 (HTS) 工作。

為方便起見,有5,000、10,000、15,00020,000 種化合物的多樣性子集,沒(méi)有結(jié)構(gòu)重疊。它們是互補(bǔ)的,并且可以被組合以創(chuàng)建更豐富多樣的篩選文庫(kù)(例如,30000,40000,以及高達(dá)50000中總化合物)。

Pre-plate Diversity Sets 及其子集是藥物發(fā)現(xiàn)項(xiàng)目的理想工具,這些項(xiàng)目需要廣泛的化學(xué)結(jié)構(gòu)差異和高質(zhì)量的類藥和類鉛化合物,以篩選來(lái)自不同類別的新的或經(jīng)過(guò)驗(yàn)證的生物靶點(diǎn),或者很少可獲得有關(guān)目標(biāo)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的信息。

主要特點(diǎn):

  • Diversity Set 的平均 Tanimoto 值為 0.409,子集值為偶數(shù)(使用 ECFP 指紋計(jì)算)

  • 與我們之前包含 50,000 種化合物 (PS5) 的多樣性 (PS5) 沒(méi)有重疊

  • Lipinski 五法則和 Veber 標(biāo)準(zhǔn)合規(guī)化合物

  • 沒(méi)有試劑。沒(méi)有反應(yīng)性和不穩(wěn)定的分子

  • PAINS 過(guò)濾器系列 A、B、C 應(yīng)用

  • 符合禮來(lái) MedChem 規(guī)則

格式化

  • 50uL 10mM DMSO 溶液

  • 384 孔微孔板(Greiner bio-one ref:781280 或 784201)

  • 每板 320 種化合物;1-2, 23-24 列空

Diversity SetAverage values
MWHBDHBAClogPRotBFsp3TPSA
50K356.643.851.492.614.870.3574.99
20K363.193.871.502.775.030.3474.60
15K355.253.841.512.554.840.3674.76
10K351.001.483.842.454.720.3675.62
5K345.831.443.832.484.620.3676.00

圖 1. Pre-plate Diversity Set 中關(guān)鍵參數(shù)的化合物分布。

來(lái)自 Pre-plate Diversity Set 的篩選化合物也屬于Life Chemicals 設(shè)計(jì)的一個(gè)或多個(gè)專有的靶向和聚焦篩選庫(kù)。主要篩選化合物庫(kù)類型之間的化合物分布如圖2所示。

圖 3 說(shuō)明了預(yù)鍍多樣性集合中最終化合物的一些代表性示例,以及它們?nèi)绾?/span>通過(guò)不同的中間 構(gòu)件與內(nèi)部?jī)?yōu)質(zhì)支架 相關(guān)聯(lián)。

圖 2. Life Chemicals 提供的不同類型篩選化合物庫(kù)之間的 Pre-plate Diversity Set 化合物分布

 

圖 3. Pre-plate Diversity Set 中最終化合物的示例及其與相應(yīng)的初始支架和構(gòu)建塊的關(guān)系